Maria Elisa Pissarra do Amaral Cunha é doutorada em Engenharia e Gestão Industrial pelo Instituto Superior Técnico.
Os seus principais interesses focam-se na área de Operações e Logística, nomeadamente, a gestão e desenho das cadeias de abastecimento, áreas onde coordenou projetos de mestrado e tem feito publicações.
Desde o ano letivo 2006/07 é Professora Adjunta da ENIDH, encontrando-se afeta ao Departamento de Transportes e Logística. De 2010 a 2014 foi coordenadora dos cursos de 1º ciclo em Gestão Portuária e em Gestão de Transportes e Logística. Atualmente é coordenadora deste último curso. Desde 2010 tem sido membro do Conselho Técnico-Científico e das Comissões Coordenadoras dos dois cursos referidos anteriormente.
Em 2018 foi nomeada coordenadora do Projeto Poliempreende, na ENIDH.