O Presidente da ENIDH é o órgão superior de governo e de representação externa da Escola, cabendo-lhe a condução política da mesma (artigo 38.º dos Estatutos - Despacho Normativo n.º 40/2008 de 18 de Agosto), bem como presidir ao Conselho de Gestão.
Eleito pelo Conselho Geral para um mandato de 4 anos, tomou posse, como Presidente da ENIDH, em 10 de Maio de 2018, o Professor Luis Filipe Baptista. Tendo sido homologada a eleição em 3 de Abril de 2018 (link) e retificado em 22 de Maio de 2018 (link). O Presidente da ENIDH é coadjuvado por dois Vice-presidentes: Professores Abel Viriato Conde Amorim e Luis Manuel Fernandes Mendonça.
artigo 38.º dos Estatutos - Despacho Normativo n.º 40/2008 de 18 de Agosto
