O nível de gestão engloba Oficiais Pilotos de 1.ª Classe, Imediatos e Capitães. O Mestrado em Pilotagem da ENIDH é indispensável à formação e certificação desses oficiais.

A conclusão com aproveitamento do primeiro ano do Mestrado em Pilotagem (MPIL) satisfaz os requisitos mínimos obrigatórios para a obtenção dos certificados de competência para Oficiais Pilotos de 1.ª Classe, Imediatos e Capitães de navios com arqueação bruta igual ou superior a 500 GT, conforme previsto no Código STCW (Regra A-II/2).